肚脐内发臭通常是肚脐内有细菌滋生，如果产生局部的感染，会形成脐炎。为处理这些情况，要注意保持肚脐内的清洁、干燥，如果有炎症，还可以通过应用抗生素，加快感染的控制。肚脐发炎比较常见，尤其是体型偏胖或肚脐较深的人，容易出现肚脐发炎。对于这种情况，由于液体容易积存在肚脐内，尤其是洗澡或日常生活用水，使肚脐内长期处于温暖、湿润的环境，同时肚脐可能会存有脏东西，不易被清洗出来，长时间便容易形成感染。
在处理肚脐发臭的时候，需注意肚脐周围的皮肤是否同时伴有发红、发热的表现。如果没有，说明局部炎症较轻，可以注意将肚脐内污染物予以清除，应用碘伏、双氧水、盐水冲洗伤口，并且注意保持肚脐内的通风，可以填塞干燥的纱球以扩张肚脐的开口。如果已经出现皮肤发红，可以应用局部或全身抗生素 ，加快感染的控制，一旦形成脓肿，便应积极的行切开引流，减缓因炎症引起的局部反应。