磷霉素氨丁三醇散对支原体引起的感染无效，磷霉素氨丁三醇散为抗菌药品，活性成分是磷霉素，对引起尿路感染的多种细菌，都有较强的作用，还可以用于预防外科手术或下尿路感染诊断过程中引起的感染，比如经尿道相关的切除术所致的感染。
磷霉素氨丁三醇散对支原体感染没有抗菌活性，出现支原体感染，应积极应用抗生素，以控制感染。对于支原体感染，一般可以选用红霉素、阿奇霉素等大环内酯类抗菌药物，或者是左氧氟沙星、莫西沙星等类的抗菌药物，治疗效果会比较好。
由于支原体感染的治疗药物起效一般都比较慢、疗程会比较长，因此在治疗过程中，患者应该注意按时到医院复查，判断治疗效果如何。必要时患者可以继续使用药物进行治疗，需要结合医生专业相关的抗感染药物治疗知识，进行判断。