上运动神经元和下运动神经元损伤的区别主要在于，上运动神经元损伤主要是在脑、脊髓等部位病变时出现，而下运动神经元损伤主要是出现在脊髓前角、发出的神经以及肌肉的这些病变。
那么上运动神经元损伤时，患者可能会出现肌张力增高，临床称为硬瘫。而下运动神经元损伤时可能会伴有肌张力降低，临床称为软瘫。那么上运动神经元损伤时，神经系统查体的肌腱反射以及肱二头肌、肱三头肌、桡骨骨膜反射等腱反射，较正常的状况下要更加活跃，甚至是比较亢进。
那么下运动神经元损伤时，可以出现上述这些反射的减低或消失，此外上运动神经元病 变，还可能伴有一些特殊反射，如病理反射。当出现上运动神经元损害时，可能会伴有巴宾斯基征阳性，就是在划足底或者足外侧时，出现脚的大拇趾的背伸，称为病理反射，它是上运动神经元损害比较特有的表现。