从目前进行微波消融的临床适应症而言，建议对于空腔脏器尽量避免消融治疗，因为进行消融治疗会对空腔脏器的壁造成损伤，比如进行胃癌消融治疗会对胃壁造成热损伤或者物理损伤，此时会出现一种非常严重的并发症，即胃肠道穿孔。
临床目前不主张广泛地使用微波消融术对于胃癌进行治疗，但存在部分特殊情况，患者无法耐受其它治疗，而且肿瘤负荷、肿瘤体积比较大，这时不对胃癌进行根治性治疗，而可以仅通过消融达到减少肿瘤负荷，缩小肿瘤体积的治疗效果。但一定要保证对空腔脏器进行消融治疗时的安全，也就是在进行术前准备时需要充分判断消融手术是否 会导致胃肠道穿孔。