目前对于硬皮病诊断主要依赖临床表现和皮肤病理检查，自身抗体16项检查只有辅助诊断和指导预后作用。如果自身抗体16项检查结果为阴性，同样不能排除本病。一方面可能是假阴性，另一方面大部分局限性硬皮病患者以及少数系统性硬皮病患者血清中自身抗体16项检查结果可以为阴性。
自身抗体检查在结缔组织病中具有重要诊断价值，硬皮病中可出现阳性抗体，包括抗Scl-70抗体、抗着丝点抗体、抗核仁纤维蛋白抗体等，其中以抗Scl-70抗体最为常见，在系统性硬皮病中阳性率高达40%-70%，具有较高诊断价值，但不能单凭此项检查诊断或排除硬皮病。