强直性脊柱炎的晚期一般都是指脊柱融合、髋关节融合，疾病已经相对比较稳定。治疗除了内科治疗，控制强直性脊柱炎的发作、活跃以外，需要骨科、脊柱外科医生，纠正脊柱畸形，还需要关节外科医生纠正髋部的强直性病变。
随着医学进步、医学技术改进，对于强直性脊柱炎晚期的治疗越来越多，特别是严重的驼背畸形、脊柱畸形、脊柱融合畸形，可以通过脊柱的矫形手术，如脊柱截骨矫形、椎弓根钉棒系统内固定，纠正后凸畸形、脊柱侧弯畸形的情况。
关节髋关节强直的关节畸形，可以通过髋关节置换手术，恢复髋部活动度、髋关节功能，使患者生活质量大幅提高。膝关节的强直，可以通过膝关节置换手术，达到改善膝关节症状、功能的效果。