三叉神经痛的诊断主要依靠典型临床表现，体格检查方面一般没有特殊表现。在发病早期，如果疼痛间歇即不疼时，体格检查没有变化，跟正常人没有区别。有些患者表现为面部感觉过敏，或轻微抚摸面部、头皮或头发，即可以诱发面部疼痛，因三叉神经痛受血管压迫刺激，神经处于高敏状态或激惹状态，几年后有些患者便表现为面部感觉减退，角膜反射也减退，面部皮肤比较粗糙，因三叉神经受血管压迫，导致神经功能减弱。
原发性三叉神经痛面部一般都有扳机点，即触发点，位于上唇或鼻翼、齿龈、口角位置，体格检查时轻微 刺激扳机点便可以诱发疼痛，因此患者几天甚至几个月不洗脸或只洗半边脸。通过体格检查诱发疼痛，有助于三叉神经痛的诊断。辅助检查包括CT和磁共振，可以明确是继发性三叉神经痛，还是原发性三叉神经痛，一般继发性，如肿瘤压迫，需要手术切除肿瘤，如果没有肿瘤压迫，可以做特殊的磁共振扫描，多数患者可以见到三叉神经有血管压迫，从而指导减压手术治疗，总之三叉神经痛的体格检查方面，阳性体征或有意义的体征并不是很多。