扁桃体出现脓肿通常是由于急性扁桃体炎，或急性化脓性扁桃体炎治疗不及时，或者使用的药物效果欠佳引起。此时病人通常在治疗的第5天还有持续性高热，且逐渐出现张口困难、说话含糊，且咽痛加剧，不能进食。检查时可以看到扁桃体一侧肿大明显，以及扁周发炎明显，进行穿刺时可以抽到脓液，诊断为扁桃体脓肿。
一般需要将脓肿切开引流，将脓性分泌物尽量引流出，同时给予足量抗生素静脉给药。局部可以使用激素类药物，雾化吸入治疗以及含片和漱口水的治疗。一般需要2周时间，扁桃体周围的脓肿或者周围炎症可以逐渐消除，康复后需要3周可以将扁桃体切除。因为慢性扁桃体炎出现脓肿后，可能会再次形成扁桃体的急性炎症，或者扁桃体的并发症，比如扁桃体周围炎或扁桃体周围脓肿。