有时在CT或者磁共振报告上看到第五脑室、第六脑室形成，正常大多数人没有第五脑室、第六脑室，两者是一种生长发育变异，部分人有第五脑室，其位于透明隔间腔，即在大脑正中间地方连接两侧，侧脑室有像一个隔板样的组织结构，称为透明隔。正常情况下，在胚胎发育过程中，胚胎发育好后透明隔融合在一起，没有透明隔间腔。
但部分人透明隔有间腔，有一个洞在长大后不闭合，形成透明格间腔。正好在侧脑室中间，由于命名时已经有第三脑室、第四脑室，透明间腔从解剖、从影像学称为第五脑室。第六脑室通常爱发于第五脑室，比较少见，称为穹隆状腔，是海马结构靠近第五脑室旁边结构出现解剖变异，形成一个小腔室，称为第六脑室。
第五脑室、第六脑室均可以鉴于部分正常人，本身没有临床意义，是一种正常生理性变性。部分担心头疼、头晕症状跟脑室形成有无关系，是否脑积水，其没有关系。第五脑室、第六脑室均不需要治疗，是生理变异，不用担心。