头孢又称为头孢菌素，阿莫西林和头孢菌素的消炎效果不能一概而论。两者均属于β-内酰胺类药物，在抗菌药物的族谱中属于同一大类，药代动力学和药效动力学基本相似，抗菌谱较广泛，因此两种药物均属于广谱抗菌素。对于这两种药物，只存在对哪类疾病较为适合或对哪一部分人群临床疗效较好的情况。通常广谱抗生素对上呼吸道感染、泌尿系统感染、消化道感染等均有着明显的疗效。
通常头孢菌素，对于治疗咳嗽、感冒(上呼吸道感染)、肺炎等疗效相对较好，而阿莫西林通常对肠炎、胃炎、泌尿系统感染等相对较好。但以上仅为临床经验所得，对于部分特殊体质的人群，可能并不如此，如部分人群对 阿莫西林较敏感，对头孢菌素却不敏感，所以通常可以直接选择阿莫西林，但部分人群正好相反，对头孢菌素较敏感。