当患者结石直径大于6mm，或药物无法缓解疼痛时，建议采用外科干预措施来治疗。体外冲击波碎石治疗是其中比较方便、简单、经济的治疗方法，其通过X线或者B超对结石进行定位，利用高能量冲击波聚焦在结石上，然后通过释放大量能量使结石碎裂，其较适合于直径小于2cm的肾结石和1cm以下的输尿管结石。对于直径超过2cm的肾结石，或者是鹿角形结石，推荐采用经皮肾镜碎石取石术、经皮肾镜或输尿管软镜联合体外冲击波碎石术。
需注意对于结石下面有梗阻、怀孕、有出血性疾病、严重性心脏病，甚至是过度肥胖者，均不适合做体外冲击波碎石术。一般结石越大，患者 需要再次碎石的风险越高，但通常不推荐碎石次数超过3-5次，并且2次碎石间隔应该在10-14天。