卵巢囊肿会不会癌变要依情况而定。滤泡囊肿和黄素囊肿这类生理性囊肿不会癌变，可以放心，需要定期复查彩超，可能囊肿会消失。炎性囊肿，如盆腔炎、附件炎引起的囊肿也可以放心，不会癌变。临床上最常见的子宫内膜异位症引起的巧克力囊肿，有一定癌变率，但是癌变率非常低，应3-6个月定期复查彩超。
卵巢囊肿也有癌变可能，所以卵巢囊肿病人一定要定期复查，对于持续存在卵巢囊肿的患者，建议手术治疗。
如果囊肿直径大于10cm，发生癌变的几率偏高，建议尽快手术。如果肿瘤标志物CA125、CA199、CEA或AFP值增高，卵巢囊肿癌变可能性较高，建议患者尽快做手术治疗，在检查囊肿时有实性 包块囊肿，或者放射线、CT提示有癌变可能时，建议患者尽快手术治疗，应该到正规医院就诊处理。不管卵巢囊肿会不会癌变，一旦发现卵巢有囊肿，要重视,应定期复查，定期查体。