双眼皮纯合子属于遗传学概念，遗传基因有两个等位基因，而等位基因内有纯合子及杂合子。纯合子指两个等位基因均是双眼皮基因，杂合子表示一个为双眼皮基因，另外一个属于单眼皮基因。如果等位基因是纯合子，则后代双眼皮几率较高；若等位基因为杂合子，则后代双眼皮几率为50%。
双眼皮需要由父母双方共同作用决定，如父母一方是纯合子，另外一方为杂合子或单眼皮纯合子，则后代50%可为双眼皮。若父母双方均为纯合子，则后代可100%出现双眼皮。如父母一方为双眼皮纯合子，另一方为杂合子，则可出现几率问题，后代可能并非均为双眼皮。