患者出现脚趾甲长肉里流脓的情况，需尽早到医院外科进行处置。常考虑有嵌甲，同时合并甲沟炎。医生会在麻醉状态下切除部分指甲，将感染组织进行去除，后期再给予规律换药。
如果患者病情较严重，还需服用抗生素进行治疗，如头孢类抗生素如头孢氨苄、头孢呋辛，或使用青霉素类抗生素等。处置后伤口处尽量不要沾水，以防止感染进一步加重，同时患者需减少活动，活动可能会引起局部疼痛加重，同时易导致出血。
在饮食上也需注意，如尽量不要饮用含有酒精的饮品、避免进食过于辛辣的食物，不要进食腌制食品等，容易导致伤口出现瘙痒不适的症状。可适当摄入富含维生素的水果，如猕猴桃、苹果、鸭梨等，适当摄入低脂肪和低胆固醇含量的优质蛋白，如新鲜的鱼肉和虾肉，以促进伤口尽快愈合。