表皮囊肿不会自己消失，因为囊肿的囊壁一旦形成后，会存在液体或浑浊的物体，所以一般不会自行消失，因此产生炎症时可能会有疼痛。当囊肿长大时可能压迫周围器官，如骶前囊肿，在尾骨以上，骶骨前的大囊肿，长大后可能压迫直场，导致排便不顺畅。
如果是肝囊肿和肾囊肿，可能5cm以下，不会产生特别的影响。如果在10cm左右，此时可能有腹胀的感觉，一般不会自己消失，除非不小心碰破，此时可能有疼痛。所以小的肝囊肿或肾囊肿可能不需要特别处理，大的囊肿可能需要手术治疗，如果是特殊部位的囊肿，在怀疑有恶变的情 况下，需要及时手术治疗。