尖锐湿疣的病原体是HPV病毒，即尖锐湿疣是由于HPV病毒感染所导致，但尖锐湿疣并不等同于HPV病毒本身。人体感染HPV病毒之后，在不同部位会有不同表现。HPV病毒感染后，皮肤上面的病毒反复增殖，会导致疣状增生，而出现疣体。疣体在不同部位有不同名称，常生长在面部、躯干、四肢。如果是凸起的疣体，表面明显粗糙，称为寻常疣。如果疣体扁平，称为扁平疣，如果是丝状凸起，或者小短棒状的疣体，称为丝状疣。而在生殖器部位的疣体，才称为尖锐湿疣。
尖锐湿疣是在HPV病毒感染以后，在外生殖器部位出现的疣体，但尖锐湿疣并不等效于HPV病毒本身。一部分患者在感染HPV病毒之后，可能并不出现疣体，处于一种潜伏感染状态，随后被人体的免疫系统逐步清除。对于尖锐湿疣的疣体，需要积极治疗，来清除疣体，同时也清除HPV病毒。