目前没有可靠的证据证实，内消瘰疬丸能够治疗甲状腺结节。
肿瘤医学界对于甲状腺结节的处理意见是，只要结节是良性的，且没有压迫气管、食管，影响患者的呼吸、吞咽以及外形，则不需要处理，不需要吃任何药物，定期复查即可。如果结节是恶性的，就需要进行手术干预。
在手术之前判断结节良恶性的方法，要根据甲状腺结节的B超结果以及甲状腺功能来综合判断。如果结节短期之内生长得非常快，或者结节里变硬、结节里出现多发的沙粒样钙化、结节边界不清晰、结节血流信号变得丰富、结节质地变硬。
还包括结节的生长方式变得纵型生长，B超描述 结节纵横比大于1，或者结节与周围软组织粘连，尤其是与颈前带状肌长在一起，或者结节突破甲状腺侵犯到气管、食管，或者结节外面有多发的颈部肿大淋巴结，就要考虑结节恶变的风险。
此外，还需要根据患者的家族史，以及小时候是否受过电离辐射的病史，来综合判断结节的良恶性。手术之前还可以进行穿刺活检，穿刺结果为良性，也是复查就可以，恶性就要进行手术干预。