肝囊肿需要就诊的科室首选的是肝胆外科。首先肝囊肿是发生于肝脏常见的良性疾病，根据原因分为寄生虫性肝囊肿以及非寄生虫性肝囊肿。寄生虫性肝囊肿，比如常见的肝棘球蚴病，又称为肝包虫病，这部分患者需要进行外科手术干预。
非寄生虫性肝囊肿，又根据原因分为先天性肝囊肿、炎症性肝囊肿、肿瘤性肝囊肿以及创伤性肝囊肿，其中先天性肝囊肿是最多见的。绝大部分患者，肝囊肿没有任何的症状。
如果囊肿比较小，而且没有任何压迫症状的这部分患者，一般也不需要特殊的治疗，更不需要吃药。但是囊肿比较大，引起压迫症状的这部分患者， 一般需要外科处理。
外科处理的方式有穿刺引流和腹腔镜下囊肿的去顶减压或者囊肿开窗术，首选肯定是腔镜下的去顶或者是开窗，优势在于首先创伤非常小，但是与穿刺相比，复发的几率非常低，治疗更加彻底。