中医治疗胃食管反流病的中药通常是促动力药物，比如枳实导滞丸、胃苏颗粒、气滞胃痛冲剂、胃逆康等，也包括枫蓼肠胃康等清热化湿药。保护胃黏膜的药物，常使用康复新液来修复黏膜，部分病人会出现反酸、烧心，常用中药的乌贝散、左金丸，可以获得比较好的疗效。
胃食管反流的病理机制一方面是胃动力差、食管动力差，导致酸无法往下清除而向上反流，另一方面是胃排空差、胃压力过大。中医治疗胃食管反流病同时需要辨证治疗与辨病治疗，辨证治疗要先判断证型，看是肝气郁结、肝胃不和，还是湿热阻滞、寒热错杂、肝胃郁热、脾胃虚寒、胃阴不足等，明确具体证型后再选择不同的药物治疗。