正常情况下掏耳朵通常不会出现咳嗽，如果掏耳朵的时候出现咳嗽反射，要注意同时存在不同程度的上呼吸道感染。上呼吸道感染常发生于鼻咽部、口咽部，可以通过咽鼓管和内耳相通，掏耳朵通常在外耳道，当上呼吸道有炎症时，外耳道的刺激会通过内耳的咽鼓管影响到上呼吸道的鼻咽部、口咽部产生相应的咳嗽动作。
遇到这样的情况要注意立即停止掏耳朵，掏耳朵时产生的咳嗽反射可能会引起手部抖动，可能会因为抖动损伤鼓膜，鼓膜损伤可能会产生不同程度的听力丧失。正常情况下掏耳朵一般不会出现咳嗽，当出现掏耳朵有咳嗽时，内耳的咽鼓管或鼻咽部、口咽部可能有不同程度的充血和水肿，外耳道的刺激可以通过内耳充血、水肿的黏膜传导到上呼吸道产生咳嗽动作。因此掏耳朵产生咳嗽后都要立即停止，避免在操作过程中因为抖动导致内耳鼓膜的损伤。