在进行泌尿系统B超检查时，受检者需平躺在检查床上，由超声医生手持探头，对泌尿系统各个器官进行依次检查，泌尿系统器官包括肾脏、输尿管、膀胱，男性还包括前列腺。通常在检查肾脏时，通过探头在上腹部两侧的位置，探查双肾的大小、质地以及是否出现积水、结石、肿瘤等情况。在探查完肾之后，如果肾脏发生积水，可以顺着积水向下探查输尿管，找到输尿管的梗阻部位。
当检查完输尿管后，要进一步检查膀胱，但是受检者需在检查之前要多饮水，通过憋尿使膀胱充盈。因为膀胱是空腔器官，如果不充盈，B超则无法仔细观察，只有在膀胱充盈之后，B超才能够充分地观察膀胱内有无病变。而男性还有前列腺，做前列腺检查时，也要求充盈膀胱，探头通过膀胱才能看到前列腺的大小、质地。此外，还有另一种方法检查前列腺的方法，即经直肠的探头进行检查。