贲门癌晚期的患者在濒临死亡前几天时，由于大量的消耗，通常会出现贫血、低蛋白血症、水肿。由于肿瘤继续侵犯，到达胃食管交界处的大血管，可能出现剧烈的呕吐、大量的呕血，甚至是黑便的情况；肿瘤转移到区域淋巴结，压迫神经出现重度的腹痛，影响睡眠或者无法入睡；肿瘤侵犯到腹腔其他器官，侵犯肝脏出现转氨酶的升高、黄疸、腹水；肿瘤侵犯输尿管，则可能出现排尿不畅；肿瘤转移至肺部，出现呼吸困难、胸痛；肿瘤转移至骨骼，会出现骨骼的剧烈疼痛；转移到胸椎和腰椎，由于这些骨头都是承重骨，全身的重量压在 这些椎体上，一旦肿瘤转移到此处，造成椎体强度下降，可能出现压缩性骨折，甚至是截瘫。
在贲门癌晚期时，肿瘤的局部浸润以及肿瘤的远端转移，都可能为患者带来难以忍受的痛苦症状。因此对于晚期贲门癌的患者，还是尽量要送到医疗机构接受支持治疗，缓解临终期的痛苦。