人体心脏内出现细菌栓子，附着于瓣膜或心肌腹壁之后，随着人体抵抗力下降，未进行有效治疗，细菌栓子会大量繁殖，从而形成大量细菌栓子。细菌栓子较脆弱，由于高速血流冲击，细菌栓子会碎裂、脱落，随心脏搏动，通过主动脉栓塞至各个动脉中。
临床常见的栓塞部位是脑部栓塞，脑部栓塞是通过弓上三个分支到脑内，形成脑脓肿，严重时会出现昏迷、偏瘫等症状。细菌栓子通过血流到降主动脉、肾动脉、肠系膜动脉，引起相应部位的感染。部分较小的栓子会随血流到人体最远端的动脉，如手指、脚趾形成小细菌栓子，造成局部组织坏死。无论何种部位栓塞，临 床中均应严格控制感染，积极进行有效治疗。