小动脉闭塞性脑梗塞的严重程度因具体情况而不同。总体来说，小动脉闭塞性的脑梗塞一般预后是良好的，死亡率和致残率也比较低。
由于小动脉的供血区域并不大，所以梗死灶的体积通常不大，不会导致严重的脑水肿和脑疝。在没有严重合并症的情况下，一般不会有生命危险。根据脑梗死发生的具体部位不同，病情也是轻重不一的。
如果脑梗死发生在不重要的脑组织区域，患者可能没有明显的症状。但是如果发生在内囊后支、脑干的这些重要部位，可能会导致一侧的肢体出现瘫痪、吞咽困难、言语不清等严重的症状。
患者的身体状况和合并症的情况也会影响病情的严重程度。年轻而且没有基础疾病的患者，一般不太严重，经过治疗后可以恢复到接近发病前的状态。但是高龄老人合并有糖尿病、冠心病等有多种慢性疾病的时候，预后可能比较差，容易发生卒中相关性肺炎、褥疮、电解质紊乱、营养不良等并发症。
从临床统计数据来看，小动脉闭塞性脑梗塞的预后相对比较好，大约有70%-80%的患者在发病后1年内，可能以临床完全恢复或者是基本恢复正常。