结石的治疗方法主要包括药物治疗、体外冲击波碎石和微创手术治疗。
第一，药物治疗是小结石的首选。对于直径小于0.5厘米的泌尿系结石，可遵医嘱使用排石颗粒、枸橼酸氢钾钠颗粒、盐酸坦索罗辛缓释胶囊等药物，通过扩张输尿管、碱化尿液，促进结石排出。尿酸结石患者还可通过药物进行溶石治疗。同时，每日应配合饮水2000-3000毫升，以增加尿量，冲刷尿道。
第二，体外冲击波碎石适用于体积中等的结石。对于直径0.5-2厘米以下的部分肾结石（肾下盏结石因解剖原因除外）以及5-7毫米的输尿管结石，可利用高能冲击波将结石粉碎，使其随尿液排出。 该方法无需开刀，具有创伤小、恢复快的优点。但肥胖患者、结石过硬或症状不明显的患者，治疗效果可能不理想。
第三，微创手术治疗适用于复杂或体积较大的结石。对于直径大于2厘米的肾结石或鹿角形结石，可采用经皮肾镜手术，通过腰部建立小通道，在直视下将结石击碎取出。对于大于7毫米的输尿管结石，可根据病情采用经尿道的腔内手术进行体内处理。此类方法结石清除率高，恢复较快。
治疗期间需严格遵医嘱用药，定期复查超声，监测结石变化。若出现持续腰痛、血尿或发热等症状，应立即就医。