食道癌最为准确的检查毫无疑问是胃镜，因为胃镜检查可以近距离的观察食道黏膜表面病变，对病变的大小、形态、周围黏膜的情况进行分析。并且非常重要的就是可以取活检，对病变的性质进行判断，是属于良性，还是恶性，这是上消化道造影以及胸部CT检查无法替代的作用。
食道癌下一步治疗像手术或者放疗、化疗，都是要基于病理诊断基础上才能进行的。上消化道造影只能是从宏观的状态下，来观察肿瘤在食道的位置、大小等情况，但无法取活检，这是致命的缺点。它比胃镜的好处就是痛苦性小，但是如果上消化道造影发现了疾病，进一步还是需要做胃镜检查。
因此怀疑食道癌的患者，在身体情况允许的情况下，建议最好进行胃镜检查明确诊断。而胸部CT也有价值，往往是胃镜的补充检查方法，主要是观察食道周围是否有淋巴结的肿大以及远处转移等 ，对食道癌分期有所帮助。