发烧本身是川崎病很重要的症状，由于川崎病可能是由于感染造成，引起超抗原性的自身免疫活化反应，因此发热本身是病理生理的表现。对于发热的处理，常规对症处理，用退热药布洛芬或者用对乙酰氨基酚等常规的退热药，对其进行退热处理。对川崎病实行病因处理，也就是用大剂量的丙种球蛋白封闭抗体，用阿司匹林起到抗凝作用，如果对因处理很好，发烧也会自然而然得到痊愈。
一定要将误区解除，不是川崎病体温越高，以后病情就越重或者出现并发症的可能性就越大，再次纠正一点，发热程度跟川崎病本身疾病对心血管损害、并发症没有直接相关性。