儿童腘窝囊肿通常发生膝关节后方，在腘窝处可以摸到囊性包块。实际为局部组织缺损，造成膝关节内积液或液体通过薄弱地方鼓起，因此膝关节周围的韧带、筋膜、关节囊组织，无论什么原因造成局部缺损，关节内的关节囊会向外突出，关节内出现腘窝囊肿，通常最常用的检查方式为B超，可清楚判断是否与膝关节相通或存在液性组织等。另外，局部如某个姿势导致腘窝囊肿出现，改变姿势后消失，通常也可以判断为腘窝囊肿。
腘窝囊肿如果没有临床症状，只是局部摸到包块，局部鼓起、隆起，无任何症状和疼痛感，也不影响活动，即可对腘窝囊肿进行观察。如果出现症状，影响活动或局部疼痛等其他不适，可以考虑手术将关节囊外侧破损组织或薄弱组织修复，薄弱得到解决后关节内组织不再膨出，即可解决。但手术复发率较高，因此没有症状，不再加重建议无需特别处理，注意观察即可。