增强CT和增强磁共振差别主要体现在三个方面，CT和磁共振成像原理不一样，造影剂不一样，CT和磁共振优缺点不一样。具体如下：
1、CT是用X射线照射人体；磁共振主要是用磁场；
2、造影剂不同，CT用的造影剂主要是碘剂，如碘佛醇、碘帕醇等。而磁共振主要用钆剂，如钆喷酸葡胺。对人体影响不一样，磁共振造影剂和CT造影剂相比发生过敏反应的几率比较小；
3、两种检查方法存在优劣性。CT最主要的优势是密度分辨率比较高，检查速度比较快，主要缺点是有辐射损伤；磁共振突出优点主要是软组织密度分辨率比较高，没有辐射损伤。缺点是成像速度相对比较缓慢。所以在实际工作中，对于CT增强或磁共振增强的选择要根据具体情况而定，来判断哪一种检查更适合病人或疾病。