首先造血干细胞移植肯定是一个有风险的治疗技术，所以它目前还是属于第三类的治疗技术，存在相当的风险，但它的风险没有生存意义那么大，所以这是区分主要矛盾和次要矛盾来进行治疗选择的。风险主要包括以下几个方面：
1、预处理相对负责任，因为预处理过程当中，因为大剂量的放化疗而引起机体这些损伤。所以有些病人可能在治疗过程当中，出现脏器功能不全，以及放化疗引起的黏膜糜烂、间质性肺炎等等副作用；
2、干细胞移植以后，一般情况下，根据植入成功与否，区分为植入成功或者植入不良，这也是个风险。不是所有的种子治疗下去都能发芽的，就像移 植以后有些干细胞可能不能在体内存活，这样长期的造血功能的恢复，造成出血和感染的机会就大大增加了，所以有可能要进行二次移植；
3、一旦植入就有可能发生排斥反应。排斥反应一般都能有效的控制，因为我们知道，脐血的移植比其他移植发生的风险相对而较少；
4、感染，感染主要是预处理以后，免疫功能低下、粒细胞缺乏，第二就是移植以后免疫抑制剂使用，或者在控制移植物抗宿主病当中，加强了免疫治疗，而造成了患者免疫功能低下，这样患者感染的机会就会大大增加；
5、比较重要的并发症是疾病复发，做移植是为了治疗白血病，但是不是说100%都是有效的。有一部分病人因为残留的白血病细胞，而导致复发。
所以移植以后，患者主要的风险是5个方面，一般情况下移植复发的风险，大概在20%左右，所以要到当地资质比较好的，有移植的资质医院进行移植。