系统性红斑狼疮发病原因不是很明确，目前多数学者认为和以下几个方面有关：
1、基因，在临床上会经常碰到母女两人或姐妹两人都是红斑狼疮，充分说明红斑狼疮有基因背景，红斑狼疮是一个具有遗传倾向性的疾病，但不是遗传病；
2、环境因素，其中紫外线会造成红斑狼疮发病，由于皮肤暴露于紫外线下会引起皮肤细胞破坏，继而激发体内免疫反应；
3、患者在接触化学药品时，例如纹眉、染头发、纹身都可能诱发红斑狼疮。因为女性雌、孕激素在红斑狼疮发病占有很重要的原因，所以部分女性患者吃避孕药后也可能会诱发红斑狼疮；
4、感染因素，一些病毒感染会诱发红斑狼疮发生；
5、免疫异常，在环境因素诱导下，导致体内淋巴细胞过度活跃，会产生一些致病性自身抗体，这些自身抗体会攻击器官，例如攻击皮肤、肾脏、血液系统、神经系统，引起相应脏器损害，所以红斑狼疮是由多因素引起来的综合性疾病。