尿道流脓说明可能存在尿道炎，这种情况需要积极地进行治疗，不建议等待自愈，而且也无法自愈。因为如果不及时治疗，会产生严重并发症。
尿道流脓最常见的是淋菌性尿道炎，淋菌性尿道炎可分为前尿道炎和后尿道炎。前尿道炎以排尿刺激症状为主，分泌大量脓液，这种脓液呈现出黄色或黄绿色，患者可出现痛性勃起。后尿道炎除刺激症状，由于病变位于后尿道，可引起排尿梗阻现象。
如果出现淋菌性尿道炎，不及时治疗，可导致病变的迁延不愈，呈慢性化趋势，还可能造成尿道狭窄，出现相应并发症。因此尿道炎需要积极主动地进行治疗，而不是等待其自愈。
尿道炎的治疗主要以抗菌素治疗为主，可根据分泌物的培养结果，选择敏感抗生素。临床上比较推荐的抗生素是头孢克肟、头孢曲松以及左氧氟沙星。如果不能排除支原体或者衣原体感染，同时可加用阿 奇霉素或者多西环素等药物进行治疗。
在治疗过程中，要求患者戒除酒精、辛辣食物，暂停性生活。如果有性伴侣，需要性伴侣同时进行检查和治疗。