患者吸烟后出现腹泻，若只是偶尔发生，则两者之间可能没有必然联系，可能是由于食物不卫生或过度刺激患者肠道，肠蠕动加快后出现腹泻的情况，或食物存在轻度变质等因素导致肠炎，使患者出现腹泻。若是长时间的现象，吸烟可能会影响到患者胃肠道功能，因为烟草中含有大量物质包括致癌物等，通过呼吸道黏膜进入血液系统，烟草中多种化合物累积到一定程度会对全身各系统、器官造成相应影响，如可能会影响到中枢神经系统功能的稳定，也会影响到胃肠调节神经功能，进而导致胃肠功能紊乱。
此外烟草中的部分有害成分进入肠道黏膜也会影响肠黏膜的免疫状态，部分患者可能会表现为肠道黏膜较敏感，对于食物中的某些成分比较敏感，也会出现肠道蠕动过强或过敏情况，导致腹泻发生。因此患者经常吸烟且吸烟后出现腹泻，说明烟草所含物质已经对身体 造成明显影响，此时提醒患者戒烟，因烟草中含有物质对人体没有好处。