临床上真菌性鼻窦炎分两大类，一大类叫侵袭性鼻窦炎；另一大类叫非侵袭性鼻窦炎。治疗方法分别如下：
1、非侵袭性真菌性鼻窦炎相对好，比较常见的比如真菌球，真菌球一般建议鼻内镜手术清理干净之后，定期复查和冲洗；如果是变异性的真菌性鼻窦炎，一般跟过敏有关，在做手术之外，还可能要增加抗过敏的治疗；
2、侵袭性真菌性鼻窦炎比较凶险，因为真菌可以侵入到血管，随着血液可能到全身各处。又分急性和慢性，不管是急性和慢性，一般建议及时的手术，清理鼻窦的真菌。同时往往在全身和局部还要给予抗真菌的药物，才有 可能得到比较好的效果。侵袭性真菌性鼻窦炎预后不是特别好，所以一定要及时治疗。