面肌痉挛注射肉毒素即肉毒杆菌毒素，主要是选择抽搐比较严重的部位。比如面肌痉挛早期一般是眼睛先出现抽搐，此时可将肉毒素注射于眼睛周围。注射后会导致眼睛周围的肌肉出现瘫痪，眼睛可能出现闭合不全等情况，因此需要将肉毒素的剂量或者注射部位减少。肉毒素是肉毒杆菌产生的一种毒素，作用机理主要是肉毒杆菌产生的毒素作用于神经肌肉接头，导致神经传导受损，不再向下传导，导致肌肉出现瘫痪，面部可能出现抽搐。
面肌痉挛注射肉毒素只是暂时控制，不可能完全治愈，一般作用的时间是3-6个月。随着时间推移会复发，长时间后面肌痉挛患者可能会出现面部及眼睛同时抽搐。此时需要注射肉毒素的部位不仅包括眼睛周围，而且需在面部抽搐的部位，尤其是口角、颊部等抽搐明显的部位，予以肉毒素治疗，减轻面部痉挛的症状。