目前，小儿斑秃原因尚不明确，斑秃为毛囊免疫性炎症，如淋巴细胞浸润、炎症反应，引起毛囊炎症导致非瘢痕性脱发，常见原因如下：
1、精神因素：斑秃小儿逐渐增多，表现为局灶脱发，或整个毛发均掉落，即普秃、全秃。通常可能与儿童精神紧张有关，如父母给予期望值高、学习压力大、受到同伴排挤等；
2、遗传易感性：25%斑秃儿童存在家族史，毛囊容易受到炎症侵犯，可能为免疫基因缺陷导致毛囊炎症反应；
3、自身免疫性疾病：如溃疡性结肠炎、系统性红斑狼疮或免疫性贫血，免疫系统自身炎症性的免疫反应 可体现于毛囊。此外，近期自身免疫系统紊乱也可导致淋巴细胞激活，攻击毛囊引起炎症反应。
总之，斑秃可能与精神因素、遗传因素，以及自身免疫异常有关。