十二指肠就在胃的远端，它也在人体中上腹稍微偏右的位置。
十二指肠包括4个部分：十二指肠球部、十二指肠降部、十二指肠水平段和十二指肠上升段，整体像英文字母C的形状，包绕着胰腺的胰头部，而胰头部主要就是位于中上腹稍微偏右的位置，因此十二指肠就在这个位置包绕着胰头。十二指肠的上段是胃的幽门，而胃的幽门是胃的出口，是胃窦和十二指肠的中间位置。
十二指肠最常见的病变位置是在刚过幽门的十二指肠球部，当十二指肠球部出现严重溃疡、糜烂时，会有中上腹和右上腹不适感，严重时会有后背部的疼痛。而十二指肠的其他位置有时也会有一些病变，如炎症、溃疡，这些病变也有可能引起上腹的不适。