每种溃疡都可能自愈，但愈合方式不同。十二指肠溃疡最常见在十二指肠球部，此部位本身相对胃狭窄很多，因此溃疡发生后充血水肿，可引起幽门梗阻。
若自愈可能形成瘢痕、假憩室，导致十二指肠变形，形成永久性幽门梗阻，生活质量受到很大影响，如出现早饱，甚至是恶心、呕吐。
十二指肠溃疡可穿孔出血，但很少发生癌变，因此不要指望十二肠溃疡自愈，最好听医嘱，规范治疗、定期复查随访。
此外，十二指肠溃疡部分患者可自愈，尤其是农村患者，忍着疼痛，不去检查可能会长好。
但是部分患者有穿孔、出血风险，在胃镜没有发展时，检出率 比较低，发生穿孔、出血时会将十二指肠和胃大部切除，后续10年，成为胃癌高发人群。因此不建议让十二指肠溃疡自行愈合，应尽早就医、规范治疗。