甲型流感病毒患者可以进行抗原筛查检测，也可以进行核酸检测。流感病毒属于正粘病毒科RNA病毒，根据核蛋白和基质蛋白不同，分甲、乙、丙、丁四型。流感病毒病原学，最简单方法为进行流感病毒抗原筛查，门诊常采用甲型流感病毒抗原筛查，用鼻拭子或者咽拭子取材后做初筛，更进一步可以做流感病毒核酸检测，可分清病毒亚型。
此外，也可以采取支气管肺泡灌洗液等下呼吸道标本进行检测，敏感性、特异性比较高。还可进行流感病毒培养，但手续耗时比较长，也可进行流感病毒IgG抗体检测，如果恢复期比急性期大于四倍以上，也有阳性 意义。