感冒的时候不能打流感疫苗，因为感冒是病毒感染引起，在感冒的同时机体有病毒感染。而流感疫苗的注射，不管是灭活流感病变还是减毒流感疫苗，都是利用流感病毒的抗原性注射到人体，使人体产生类似对抗流感病毒的反应。在机体原有病毒感染的基础上再注射流感疫苗，可能会加重反应的出现或者使基础的病毒感染加重，所以在感冒的时候不能注射流感疫苗。
其实不只是感冒，在机体的急性感染期都不主张注射流感疫苗。因为如果注射流感疫苗可能会加重感染发生，并且可能会出现更多流感疫苗不良反应，所以在感冒的时候要注意不要接种流感疫苗。如果需要接种，可以换时间进行接种，也就是在机体没有感染的状态下来进行接种。