患者幽门螺杆菌检查阴性，表示通过检查方法目前没有检测到幽门螺杆菌感染。临床上检查幽门螺杆菌方法较多，多数是定性检查，检查结果描述为阴性或者阳性，每种检查都存在一定敏感性和特异性，可能存在假阳性或假阴性情况，因此需要不同检查方法综合判断。
幽门螺杆菌检查常用的无创方法，包括C-13或C-14呼气试验，以及大便查幽门螺杆菌抗原，还可通过抽血检测幽门螺杆菌抗体。患者在做胃镜检查的同时，可以通过在胃镜下取一块胃黏膜组织，用快速尿素酶方法进行幽门螺杆菌判断，如果变色指示剂颜色发生改变，则为阳性；如果没有改变可能是阴性。