输卵管不通不会生化妊娠，二者之间无任何关系。输卵管不通一般为先天发育不良、炎症、子宫内膜异位症或输卵管结核等疾病导致，生化妊娠指怀孕后胚胎在未见胎心、胎芽之前则停止发育。生化妊娠患者有时未进行查血或查尿，不知道自己怀孕，通常误认为月经延迟。
生化妊娠的原因较多，临床多见于偶发事件，即男方和女方均无异常，胚胎自身发育过程中的某个环节出现问题，如染色体问题导致不能正常发育，引起流产。此外，还有母体因素，如免疫、凝血、内分泌、子宫问题均可导致胚胎不能正常发育。男方，如染色体原因也可导致胚胎发育异常，但临床较少见。