大部分病人的甲胎蛋白会在肝癌术后1个月左右恢复正常，有些病人合并慢性乙肝，可能甲胎蛋白会持续存在，维持在一定水平，但并不会出现进行性升高。
若患者出现甲胎蛋白持续维持的情况，则需要做进一步进行肝炎筛查，查看是否存在慢性活动性乙肝，或者肝硬化的情况，并根据筛查结果，进行相应的抗病毒治疗或护肝治疗等，此类措施对于肝功能恢复以及甲胎蛋白的恢复有一定帮助。
若患者的甲胎蛋白术后3个月后仍未恢复正常，则怀疑存在术后残留，手术未达到根治状态，此时需要定期进行观察，2-3个月复诊一次，查看是否存在新的肿瘤病灶。