尿道结石通常来自肾脏和膀胱，出现疼痛后的处理方式如下：
1、肾脏结石：如果位置比较固定，也没有梗阻，并不会引起疼痛。如果肾脏结石在往下掉的过程中掉到输尿管里，可能会引起临床上非常常见的急症即肾绞痛，疼痛往往比较明显。但引起这种疼痛的结石并不大，大部分通过保守治疗，即通过药物治疗解痉、排石、消炎，石头排出来后自然就不疼。还要求不疼时大量喝水、大量运动促进结石往下排，主要是止痛、解痉、排石；
2、膀胱结石：可能平时没有症状，只是排尿后引起疼痛，这时仍然需要及时处理，大结石可能需要通过手术方式。尿道结石往外排的过程中卡到尿道里，也可能会引起非常明显的疼痛或排尿中断、尿不出来、尿分叉。这部分结石有时很难往外排，需要手术将结石取出。对于尿道结石引起的疼痛应当止疼，再根据结石位置、大小进行相应治疗，有部分通过药物治疗，有部分患者需要通过手术治疗，结石处理后疼痛也就没有了。