胃溃疡和十二指肠溃疡发病原因主要有三种，内源性幽门螺杆菌感染、胆汁反流，以及外源性药物，如阿司匹林等导致的溃疡出血。如果是长期服用阿司匹林类药物预防心脑血管疾病的患者，一定要注意大便情况。若出现黑便，则可能存在溃疡。因为此时出现溃疡往往并无疼痛，病人症状不明显，常导致误诊。
对于胃溃疡和十二指肠糜烂或十二指肠溃疡，一般情况下是胃酸增高或胃黏膜屏障下降两个原因导致。通常溃疡病形成机制存在平衡学说，即存在损害因素和保护因素。如果损害因素增加，如高酸、酸分泌增加、胆汁反流到胃 内、阿司匹林等药物损害胃黏膜、幽门螺杆菌感染后对胃黏膜造成损伤，均会增加损害方面的因素。还有胃黏膜屏障下降，如年龄过大或存在疾病、胃黏膜血流下降等导致胃溃疡或十二指肠球部溃疡。