绝大多数脑炎都是可治性疾病，经过精心治疗，可以改善甚至完全恢复。如果由于脑炎昏迷，甚至住进ICU，称之为重症脑炎，有一定死亡率，部分患者恢复不好，可能长期昏迷甚至最终救不过来。但是相当一部分患者可以治疗，只是急性期脑水肿较重，炎症没有得到有效控制，病原体可能还没有查明，此时较危险。一旦度过危险期并明确病原体，且对治疗有一定反应，脑炎引起的昏迷还有可能改善，患者也有可能清醒。
因此因脑炎昏迷住进ICU时，应尽力进行治疗，不放弃任何希望。由脑炎导致的昏迷通常是一过性昏迷，有一定的治疗机会和治疗价值。但如果长期昏迷不醒，甚至生命体征出现严重改变，此时有可能预后不良，恢复较差。