女性和男性的湿疣的治疗稍微有点不一样，因为生理结构不一样。女性既有外阴、宫颈，中间还有一段阴道、阴道壁，所以女性的湿疣其实比男性的湿疣治疗起来要困难一点，考虑的因素要多一些。
而且有的女性湿疣不只是低危的病毒感染，有时候还有高危的病毒感染。如果是低危和高危的病毒同时存在，还要考虑癌变的风险。所以女性的湿疣既要考虑低危，又要考虑高危，这些方面都需要进行筛查。
除此之外，女性的湿疣的治疗既要考虑外阴、宫颈，还要考虑阴道壁。而且既要考虑疣体或癌变的预防本身，还要考虑能不能够尽量减少或者清除病毒，所以治疗起来比较复 杂。
女性湿疣的治疗包括物理治疗、冷冻、光动力、微波、激光等，然后还要用些外用药。通过外用药来减少病毒的存在或者降低病毒量，从而减少复发。