头孢菌素类是常用的抗感染性疾病的抗菌药物，临床应用的时候耐受性还是比较好的，多数不良反应程度也比较轻，多为一过性的，严重的不良反应比较少见。
最常见的不良反应主要是胃肠道反应，比如腹泻、恶心、呕吐，还会引起过敏反应，比如皮疹、皮肤瘙痒，以及注射局部反应，肌内注射以后局部疼痛会发生硬结、红肿，还有少见的静脉滴注引起的血栓静脉炎，少数患者会出现一过性的转氨酶升高或胆红素升高。
使用时间长了会出现伪膜性肠炎，还会影响血液系统，比如引起低凝血酶原血症，引起血小板减少，中性粒细胞、白细胞减少，是头孢菌素常见的不良反应。
严重的不良反 应虽然比较罕见，但是由于可能会引起过敏性休克甚至死亡，临床应用的时候还需要注意。在应用30分钟之内要密切观察，发生患者有不适应该及时停药，并采取及时的抢救措施以免发生意外。