女性不来月经的危害与导致不来月经的原因有关，不同的原因会造成不同的危害，主要有以下几点：
1、卵巢功能衰退：女性40岁以上，卵巢功能衰退导致不来月经。雌激素水平低下会导致绝经后的危害，引起女性出现更年期症状，如潮热、出汗等血管收缩症状，有时还会引起心血管相应疾病的发生。长期雌激素低下可能导致女性出现骨质疏松，甚至引起病理性骨折；
2、多囊卵巢综合征：年轻女性不来月经可能是由于生殖内分泌疾病，如多囊卵巢综合征，危害是由于激素水平的紊乱，尤其是高雄激素血症所导致的危害，如女性出现肥胖、多毛、痤疮或抑制排卵，造成女性继发闭经和不孕症，长期危害还可能导致女性代谢性疾病，如高血压、糖尿病、高脂血症等，造成较为长久的危害。因此导致女性不来月经的不同原因，对女性的身体都会造成不同程度的危害。女性如果出现不来月经的情况，一定要及时到医院就诊，医生会根据具体情况，采取相应的检查手段判断具体原因。