儿童癫痫属于慢性病，各种原因可导致儿童癫痫发作。目前国际抗癫痫联盟将儿童癫痫的病因学分为六类，具体如下：
1、遗传性，由于儿童基因发生点突变或发生微缺失、微重复以及由于染色体异常导致癫痫发作；
2、颅内结构发生变化，可为先天性发育异常，如局灶性皮质发育不良、脑穿通畸形、灰质异位症、无脑回畸形或巨脑回畸形等，儿童既往存在颅内感染或颅内出血，以及脑外伤后导致脑软化灶结构异常；
3、代谢原因，由于内环境出现变化，代谢紊乱导致癫痫发作，代谢因素可以是基因突变导致；
4、免疫性癫痫，癫痫发作与免疫性脑炎存在密切关系；
5、感染后 并发癫痫，在癫痫前存在颅内感染，颅内感染得到有效治疗后出现癫痫并发症；
6、目前医学上无明确原因的癫痫。